Существует ли различие между частотой ложноотрицательных результатов теста у асимптомных пациентов (более низкая вирусная нагрузка) по сравнению с симптомными пациентами (более высокая вирусная нагрузка)?
Вероятнее всего большее число ложноотрицательных результатов отмечается у асимптомных пациентов с коронавирусной инфекцией. Однако на данный момент не было выполнено крупных исследований, оценивших различия между группами (в том числе, необходимо проанализировать сероконверсию и провести тесты ПЦР).
- Следует отметить, что бессимптомные пациенты могут выделять вирус в высоких титрах В настоящее время серологические лонгитюдные исследования находятся в процессе.
Исследования, выполненные в домах престарелых и круизных лайнерах показали, что значительное количество пациентов имели вирус, культивируемый за 6 дней до появления симптомов.
Позволяют ли доступные в настоящее время тесты различать SARS-CoV-2 и другие коронавирусы, которые могут быть похожими? Как это повлияет на точность и надежность теста?
- Доступные мультипанели тестов ПЦР на респираторные вирусы не определяют SARS-CoV-2. В настоящее время многие компании работают над тем, чтобы включить тест на новый коронавирус в уже имеющиеся панели тестов.
- Тест на ПЦР SARS-CoV-2 не позволяет определить наличие других коронавирусов (HCoV-OC43, HCoV-229E, HCoV-NL63 и HCoV-HKU1) или MERS-CoV.
- Нельзя сравнивать доступные в настоящее время тесты на коронавирус ввиду их различной чувствительности и специфичности. Более того, даже если тест имеет специфичность от 96% до 98%, если вероятность претеста COVID-19 составляет <5%, более вероятно, что результат будет ложноположительным, чем истинно положительным — и это одна из ключевых причин почему массовое серологическое тестирование не рекомендуется.
- Причинами ложноположительных результатов являются перекрестная реактивность с другими коронавирусами, образование антител из-за других механизмов или низкая точность теста.
Источник: Eugenia Yun. COVID Testing FAQ, From Reinfection to Persistent Positives. Medscape. June 10, 2020.
Определение
Новая коронавирусная инфекция COVID-19 – это острое инфекционное заболевание, относящееся к группе ОРВИ (острых респираторных вирусных инфекций). Его вызывает новый коронавирус SARS-CoV-2.
Основным источником инфекции является больной человек, в том числе находящийся в инкубационном периоде заболевания (между моментом заражения и появлением первых жалоб).
Наибольшую опасность для окружающих человек представляет в последние два дня инкубационного периода (больной еще не знает, что болен, но уже выделяет вирус) и в первые дни болезни (поскольку выделяет максимальное количество вируса).
Пути передачи вируса
Передача инфекции осуществляется воздушно-капельным и контактным путями. Воздушно-капельный путь считается основным и реализуется при кашле, чихании и разговоре на близком (менее 2 метров) расстоянии. Контактным путем можно заразиться через рукопожатия, объятия и поцелуи, а также через поверхности и предметы, пищевые продукты, обсемененные вирусом.
Жалобы при COVID-19 неспецифичны и встречаются при других ОРВИ. В большинстве случаев болезнь протекает нетяжело. Нередко отмечается и вовсе бессимптомное течение: человек чувствует себя хорошо, не предъявляет никаких жалоб, а о перенесенной болезни узнает случайно, сдав анализы.
Классификация COVID-19
По степени тяжести:
- Легкое течение (около 80% заболевших).
- Температура тела до 38°C, кашель (чаще сухой, но может быть и с мокротой), общая слабость, боли в горле; возможно, снижение обоняния и вкуса, расстройство стула, различные кожные высыпания.
- Среднетяжелое течение.
- Температура тела выше 38°C.
- Частота дыхания более 22/мин.
- Одышка – ощущение нехватки воздуха, сопровождающееся изменением частоты, глубины и ритма дыхания при обычных физических нагрузках.
- Изменения на КТ (компьютерной томографии) органов грудной клетки, типичные для вирусного поражения (объем поражения минимальный или средний; КТ 1-2).
- Сатурация кислорода (SpO2) – насыщение крови кислородом менее 95%.
- СРБ (С-реактивный белок) сыворотки крови более 10 мг/л.
- Тяжелое течение.
- Частота дыхания более 30/мин.
- SpO2 менее 93%.
- Снижение уровня сознания или возбуждение.
- Нестабильная гемодинамика (снижение артериального давления менее 90/60 мм рт. ст., уменьшение объема выделяемой мочи).
- Изменения в легких на КТ органов грудной клетки, типичные для вирусного поражения (объем поражения значительный или субтотальный; КТ 3-4).
- Изменения ряда лабораторных показателей, определяемых в условиях отделения интенсивной терапии.
- Крайне тяжелое течение – множественные тяжелейшие поражения органов и систем с необходимостью респираторной поддержки (инвазивной вентиляции легких).
- Изменения в легких при КТ, типичные для вирусного поражения критической степени (объем поражения значительный или субтотальный; КТ 4).
Лабораторная диагностика
Лабораторная диагностика новой коронавирусной болезни COVID-19 подразумевает обнаружение вируса, подтверждение перенесенной инфекции, оценку степени выраженности воспаления, возможных осложнений (присоединения бактериальной инфекции, развития тромбозов).
Наличие вируса в организме можно выявить путем взятия мазков из носоглотки (носа) и ротоглотки (зева).
- Обнаружение РНК SARS-CoV-2 методом ПЦР;
- Обнаружение вирусных антигенов (экспресс-диагностика).
Для оценки иммунного ответа (наличия иммунитета к COVID-19, подтверждения текущей или перенесенной инфекции) определяют антитела классов IgM, IgG к SARS-CoV-2 в крови.
- Обнаружение антител IgG и IgM к коронавирусу – качественный (есть или нет антитела) и количественный (сколько антител) методы.
- Обнаружение антител IgG и IgM к коронавирусу (экспресс-диагностика).
Экспресс-методы выявления антигена в мазке или антител в крови всегда качественные, то есть результат интерпретируется как положительный («обнаружено») или отрицательный («не обнаружено»).
Их достоинства – быстрое (в течение 20-30 минут) получение результата, возможность использования в домашних условиях. Недостаток – не слишком высокая точность: из-за невысокой чувствительности тесты не всегда могут определить пациентов с новой коронавирусной болезнью (не определяют примерно каждого четвертого). Если тест положительный, то это практически всегда верно. Отрицательный тест не исключает наличие болезни. Экспресс-методы могут использоваться в первичной диагностике для определения дальнейшей тактики обследования.
Дополнительные методы лабораторной диагностики
- Клинический (общий) анализ крови, С-реактивный белок, прокальцитонин – для исключения присоединения бактериальной инфекции.
С-реактивный белок (СРБ, CRP)
С-реактивный белок – белок острой фазы, чувствительный индикатор повреждения тканей при воспалении, некрозе, травме.
Синонимы: Анализ крови на СРБ; С-реактивн�…
Прокальцитонин (Procalcitonin)
Синонимы: Анализ крови на прокальцитонин; ПКТ. Procalcitonin; PCT.
Краткая характеристика определяемого вещества Прокальцитонин
Прокальцитонин является прогормоном ка�…
D-димер (D-dimer)
Синонимы: Фрагмент расщепления фибрина.
D-dimer, Fragment D-dimer, Fibrin degradation fragment.
Краткая характеристика определяемого вещества D-димер
D-димер представляет собой рас�…
ПЦР- мазки из носоглотки и ротоглотки для выявления РНК SARS-CoV-2
Коронавирус SARS-CoV-2, определение РНК, качественный анализ, в мазке со слизистой носоглотки и/или ротоглотки — основной метод диагностики текущей инфекции.
Срок выполнения исследования на выявление РНК SARS-CoV-2 в лабораториях медицинских организаций не должен превышать 48 часов с момента получения биологического материала. Если отбор проводится не в лабораторном центре, необходимо учитывать время доставки проб до лаборатории. Срок выполнения исследований в референтной лаборатории – не более 48 часов с момента доставки образца.
Взятие мазка методом ПЦР для обнаружения РНК SARS-CoV-2 проводится:
- всем лицам с признаками ОРВИ;
- пациентам с диагнозом «внебольничная пневмония»;
- лицам, контактировавшим с больным COVID-19, при появлении симптомов, не исключающих COVID-19;
- работникам медицинских организаций, имеющим риск инфицирования при профессиональной деятельности, до появления IgG – 1 раз в неделю; при появлении симптомов, не исключающих COVID-19, – немедленно;
- прибывшим на территорию Российской Федерации из-за границы;
- взрослым и детям из организованных коллективов — интернатов, детских домов, пансионатов для пожилых и т.д. при появлении респираторных симптомов.
Правила подготовки к процедуре забора мазка
Врач должен взять мазок из ротоглотки и носоглотки. Мазки со слизистой оболочки носоглотки и ротоглотки собираются в одну пробирку для большей концентрации вируса (при его наличии).
Пациенту за 3-4 часа до взятия мазка нельзя есть, пить, чистить зубы, полоскать рот и горло, использовать спрей-освежитель для ротовой полости, жевать жевательную резинку, курить. Кроме того, нельзя промывать нос, использовать спреи, капли, мази для носа. Это позволит сохранить для исследования максимально возможное число пораженных вирусом клеток эпителия (наружного слоя) верхних дыхательных путей.
Интерпретация результатов
«Обнаружено» – результат говорит о наличии РНК вируса в пробе биоматериала пациента, то есть человек инфицирован коронавирусом, заразен для окружающих.
В случае получения в лаборатории положительного теста результат выдается как «первично положительный», а биоматериал передается для проведения подтверждающего теста в референсный центр Роспотребнадзора.
Результат первичного тестирования может быть как подтвержден, так и не подтвержден референсным центром. При получении первично-положительного результата пациенту необходимо соблюдать режим самоизоляции до получения результата подтверждающего теста. Формулировка «обнаружено» в результате подтверждающего теста означает, что исследование пробы пациента выполнено дважды, первично положительный результат подтвержден дополнительным исследованием в референсном центре. При получении окончательного результата «обнаружено» заболевшему предписывается соблюдать режим самоизоляции и обратиться к врачу.
«Не обнаружено» – результат говорит об отсутствии РНК вируса в пробе пациента, значит в организме человека нет коронавируса.
К сожалению, ПЦР-диагностика иногда может давать ошибочные результаты. Причины ложноотрицательных результатов (человек болен COVID-19, а результат теста отрицательный):
- количество вируса в образце меньше порога чувствительности тест-системы из-за некорректной подготовки пациента к исследованию или из-за небольшого количества вируса в организме (низкая вирусная нагрузка), например, при бессимптомном течении или в период выздоровления;
- некорректное взятие мазка – например, только из зева или только из носа, погрешности в технике забора материала;
- нарушение рекомендованного срока хранения взятого образца;
- ненадежная система идентификации образцов, что ведет к получению чужого результата.
Исследование на антитела к коронавирусу
Антитела, или иммуноглобулины – специальные белки, которые вырабатывает иммунная система человека в ответ на попадание в организм любого инфекционного агента, в том числе SARS-CoV-2.
Антитела класса М (IgМ) к SARS-CoV-2 появляются, как правило, на 7-10 день болезни. Они могут сохраняться в организме человека до 2-3 месяцев. Поэтому их обнаружение говорит о текущей или недавно перенесенной инфекции.
Антитела класса G (IgG) к SARS-CoV-2 обнаруживают обычно через 10-14 дней после начала болезни. Выявление IgG-антител к возбудителю COVID-19 свидетельствует, что человек выздоравливает или уже переболел коронавирусной инфекцией. Длительность их сохранения в организме на сегодняшний день точно неизвестна.
Тестирование на антитела к вирусу SARS-Cov-2 рекомендуется использовать в следующих случаях:
- в качестве дополнительного метода диагностики острой инфекции (не ранее 7-го дня болезни для IgM, не ранее 10-14-го дня болезни для IgG) или при невозможности по какой-либо причине исследования мазков;
- для выявления лиц с бессимптомной формой инфекции;
- для установления факта перенесенной ранее инфекции при обследовании групп риска и проведении массового обследования населения для оценки уровня популяционного иммунитета;
- для отбора потенциальных доноров иммунокомпетентной (антиковидной) плазмы.
Донорами антиковидной плазмы могут стать лица в возрасте от 18 до 55 лет, с отсутствием противопоказаний к донорству (ряд хронических заболеваний, беременность), которые болели коронавирусной инфекцией и выздоровели, при условии, что с начала болезни прошло не менее 5 недель.
На начало 2021 года в официальных источниках приводятся следующие показатели антител, считающиеся достаточными для донорства: IgG > 40 и IgM ≥ 1,5 или IgG > 80 и IgM ≥ 0. Решение о том, может ли человек стать донором антиковидной плазмы, принимает врач.
Отдельно стоит сказать об оценке степени иммунной защиты (формировании иммунитета) после вакцинации. На сегодняшний день известно, что после перенесенной коронавирусной инфекции в организме могут формироваться антитела (IgG) к нескольким белкам коронавируса. Исследуемые после болезни IgG – это антитела к так называемому N-белку коронавируса (исследуется в большинстве лабораторий).
Для оценки иммунитета после вакцинации имеет значение только выявление определенных IgG – антител к спайковому (S) белку SARS-CoV-2 (качественный).
Этот анализ выявляет наличие или отсутствие антител. При повторном выполнении количественного анализа можно оценивать устойчивость иммунного ответа по динамике уровня этих антител. Тест на антитела к N-белку не информативен для оценки поствакцинального иммунитета.
Объем сроки и кратность исследований при новой коронавирусной болезни COVID-19
Объем, сроки и кратность лабораторных исследований зависят от степени тяжести заболевания. Легкое течение заболевания с наблюдением пациента в амбулаторных условиях, как правило, не требует дополнительных лабораторных исследований. В случае среднетяжелого и тяжелого течения выполняются следующие исследования:
Клинический анализ крови: общий анализ, лейкоформула, СОЭ.
Биохимический анализ крови (мочевина, креатинин, калий/натрий/хлор, глюкоза, АлАт, АсАт, билирубин общий, альбумин, ферритин).
Мочевина (в крови) (Urea)
Синонимы: Диамид угольной кислоты; Карбамид; Мочевина в крови; Азот мочевины.
Urea nitrogen; Urea; Blood Urea Nitrogen (BUN); Urea; Plasma Urea.
Краткая характеристика аналита Мочевина
Моче�…
Креатинин (в крови) (Creatinine)
Синонимы: Анализ крови на креатинин; Сывороточный креатинин; Креатинин сыворотки, оценка СКФ. Сreat; Сre; Blood Creatinine; Serum Creatinine; Serum Creat.
Краткая характеристика определя�…
Калий, натрий, хлор в сыворотке крови (К+, Potassium, Na+, Sodium, Сl-, Chloride, Serum)
Синонимы: Анализ крови на электролиты; Электролиты в сыворотке крови. Electrolyte Panel; Serum electrolyte test; Sodium, Potassium, Chloride; Na/K/Cl.
Краткая характеристика определяемых �…
Глюкоза (в крови) (Glucose)
Материал для исследования
Сыворотка или плазма крови. Если нет возможности центрифугировать пробу через 30 минут после взятия для отделения сыворотки/плазм…
Билирубин общий (Bilirubin total)
Синонимы: Общий билирубин крови; Общий билирубин сыворотки.
Totalbilirubin; TBIL.
Краткая характеристика определяемого вещества Билирубин общий
Билирубин – пигмент �…
Альбумин (в крови) (Albumin)
Синонимы: Человеческий сывороточный альбумин; ЧСА; Альбумин плазмы;
Human Serum Albumin; ALB.
Краткая характеристика исследуемого вещества Альбумин
Альбумин – эт…
Ферритин (Ferritin)
Синонимы: Анализ крови на ферритин; Депонированное железо; Индикатор запасов железа. Serum ferritin.
Краткая характеристика определяемого вещества Ферритин
Ферритин &n…
Биохимический анализ крови не дает специфической информации о коронавирусной инфекции, но обнаруживаемые отклонения могут указывать на наличие патологии со стороны внутренних органов, декомпенсацию сопутствующих заболеваний и развитие осложнений. Он может иметь прогностическое значение, оказывает влияние на выбор лекарственных средств и режим их дозирования.
Значимое повышение С-реактивного белка (СРБ) может говорить в пользу бактериальной инфекции, коррелирует с тяжестью течения, распространенностью воспаления и прогнозом при пневмонии.
С-реактивный белок (СРБ, CRP)
С-реактивный белок – белок острой фазы, чувствительный индикатор повреждения тканей при воспалении, некрозе, травме.
Синонимы: Анализ крови на СРБ; С-реактивн�…
Прокальцитонин при коронавирусной инфекции, в том числе с поражением легких, находится в пределах нормальных значений.
Прокальцитонин (Procalcitonin)
Синонимы: Анализ крови на прокальцитонин; ПКТ. Procalcitonin; PCT.
Краткая характеристика определяемого вещества Прокальцитонин
Прокальцитонин является прогормоном ка�…
Повышение прокальцитонина, как и СРБ, свидетельствует о присоединении бактериальной инфекции и коррелирует с тяжестью течения, распространенностью воспаления и прогнозом при бактериальных осложнениях.
Значимое повышение D-димера может свидетельствовать о наличии тромбозов.
D-димер (D-dimer)
Синонимы: Фрагмент расщепления фибрина.
D-dimer, Fragment D-dimer, Fibrin degradation fragment.
Краткая характеристика определяемого вещества D-димер
D-димер представляет собой рас�…
КТ органов грудной клетки при COVID- 19
Методы лучевой диагностики (рентгенография и КТ органов грудной клетки без внутривенного контрастирования) применяют для выявления пневмоний, вызванных COVID-19, их осложнений, дифференциальной диагностики с другими заболеваниями легких, а также для определения степени выраженности и динамики изменений, оценки эффективности проводимой терапии.
КТ имеет высокую чувствительность в выявлении изменений в легких, характерных для COVID-19.
Как и любое другое обследование, КТ должно назначаться по строгим показаниям и проводиться после соотнесения пользы и потенциального вреда.
Нельзя забывать, что выполнение КТ сопряжено с лучевой нагрузкой. Кроме того, во время пребывания в отделении существует дополнительный риск инфицирования COVID 19.
Ограничениями КТ в сравнении с рентгенографией являются меньшая доступность технологии в отдельных медицинских организациях, городах и регионах; недоступность исследования для части пациентов, находящихся на ИВЛ.
Несмотря на бОльшую доступность, относительно низкую стоимость рентгенографии по сравнению с КТ, именно при COVID-19 предпочтительнее проведение КТ. Дело в том, что рентгенография в данном случае недостаточно информативна.
Для поражения легких при COVID-19 характерно снижение воздушности легочной ткани — так называемое «матовое стекло». Эти изменения не являются строго специфичными для COVID-19, они встречаются, хотя и реже, и при других вирусных инфекциях. КТ точно оценивает степень тяжести пневмонии при COVID-19, которая определяется количеством пораженной легочной ткани:
КТ-1 – до 25 %,
КТ-2 — до 50 %,
КТ-3 — до 75 %,
КТ-4 – более 75%.
Рекомендовано проведение КТ органов грудной клетки пациентам при среднетяжелом, тяжелом и крайне тяжелом течении острой респираторной инфекции с целью принятия решения о госпитализации, оценки характера изменений и объема поражения легких, а также динамики процесса и определения прогноза заболевания.
КТ может выявлять изменения в легких у значительного числа пациентов с бессимптомной и легкой формами заболевания. Результаты КТ в этих случаях не влияют на тактику лечения и прогноз заболевания при наличии лабораторного подтверждения COVID-19. Поэтому массовое применение КТ для скрининга бессимптомных и легких форм болезни не рекомендуется.
Не рекомендовано применение методов лучевой диагностики при отсутствии симптомов ОРВИ у пациентов с положительными результатами на РНК SARS-CoV-2. Данные лучевого исследования не заменяют результаты обследования на РНК SARS-CoV-2. А отсутствие изменений при КТ не исключают наличия COVID-19 и риска развития пневмонии через некоторое время после проведения исследования.
Источники:
- Временные методические рекомендации. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Версия 8.1 (01.10.2020) Министерство здравоохранения Российской Федерации. Утверждены заместителем министра Здравоохранения Российской Федерации Е. Г. Камкиным. 227 с.
- Доктор Питер Петербургский сайт о здоровье. Специалист лаборатории объяснила, почему ПЦР-тесты на коронавирус могут выдавать ошибку 02.12.2020.
ВАЖНО!
Информацию из данного раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. В случае боли или иного обострения заболевания диагностические исследования должен назначать только лечащий врач. Для постановки диагноза и правильного назначения лечения следует обращаться к Вашему лечащему врачу.
Для корректной оценки результатов ваших анализов в динамике предпочтительно делать исследования в одной и той же лаборатории, так как в разных лабораториях для выполнения одноименных анализов могут применяться разные методы исследования и единицы измерения.
Информация проверена экспертом
Лишова Екатерина Александровна
Высшее медицинское образование, опыт работы — 19 лет
Поделитесь этой статьей сейчас
Рекомендации
-
12418
14 Ноября
-
211
02 Сентября
-
88612
03 Марта
Похожие статьи
Тугоухость
Тугоухость: причины появления, при каких заболеваниях возникает, диагностика и способы лечения.
Сухой кашель
Кашель – это естественная, защитная реакция организма на разнообразные раздражители. В некоторых случаях кашель может быть симптомом болезни. Сухим называется кашель, при котором мокрота не выделяется вообще или выделяется в очень небольшом количестве.
Отек легких
Отек легких: причины появления, при каких заболеваниях возникает, диагностика и способы лечения.
Миалгия
Миалгия: причины появления, при каких заболеваниях возникает, диагностика и способы лечения.
В Роспотребнадзоре объяснили ложноотрицательные ПЦР-тесты при COVID-19
Ложноотрицательный результат теста на коронавирус может происходить из-за того, что инфицированный человек сдает анализ на поздних стадиях болезни. Такое мнение выразили в Роспотребнадзоре. Там подчеркнули, что вырастает шанс получить такой результат у больного COVID-19 после четвертого-пятого дня болезни.
При заражении COVID-19 у больного отсутствуют специфические признаки, которые характерны только для этой инфекции. Наиболее часто заразившийся сталкивается с респираторными симптомами, что может говорить не только о коронавирусе, но и ряде других заболеваний, включая грипп и ОРВИ.
По этой причине единственным способом диагностики коронавируса остается ПЦР-тестирование. Впрочем, в довольно большой доле случаев они оказываются недостоверными, о чем еще год назад говорили специалисты Минздрава, указывая на то, что 30-40% тестов дают ложноотрицательный результат. В частности, тогда считалось, что в большей части случаев на это влияют ошибки при заборе материала и качество самого теста.
Тем не менее существует и другое обоснование. По словам заместителя директора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора профессора Натальи Пшеничной, на результате анализа сказывается период заболевания, в который заболевший сдает ПЦР-тест. На ранних стадиях болезни получить положительный результат значительно выше.
«После четвертого-пятого дня болезни вероятность обнаружить вирус в носоглотке снижается, а респираторные симптомы могут быть в это время в самом разгаре. Если проводить тестирование в эти сроки, то можно получить отрицательный результат», — приводит слова специалиста РИА «Новости».
Общую картину по тестированию на COVID-19 также дополняет тот факт, что среди новых заболевших появляются и вакцинированные люди, но они при этом выделяют вирус в меньшем количестве и не такое продолжительное время, констатировала замдиректора Московского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского Татьяна Руженцова.
Однако сомнительный или ложный результат может давать любая тестовая система. Эксперты неоднократно выражали мнение, что ложные результаты на коронавирус связаны связаны как с ошибками медработников, так и пациентов. Иными словами, речь идет о несоблюдении правил и рекомендаций по тестированию.
Еще одну версию выдвигал директор Института медицинской паразитологии, тропических и трансмиссивных заболеваний Сеченовского университета Александр Лукашев. Газете «Известия» он рассказывал, что COVID-19 — специфический вирус в том плане, что его можно не обнаружить в доступном биоматериале. Если другие коронавирусы размножаются в носоглотке и ротоглотке, где их можно легко найти, то SARS-CoV-2 у значительной части больных присутствует только в бронхах.
Согласно данным Всемирной организации здравоохранения, точность ПЦР-тестов на коронавирус, несмотря на их неоднозначную оценку, составляет 95%.
Вместе с этим в ВОЗ подчеркивают, что на результаты тестирования влияет очень много факторов. Это касается и процесса забора материала, и транспортировки, и хранения биоматериалов. Важно и то, правильно ли подготовлен пациент к сдаче анализа и проверена ли тест-система в конкретной лаборатории.
Ссылка на публикацию:
rambler.ru
https://ria.ru/20201206/ptsr-1586583720.html
«Цена ошибки высока». От чего зависит результат ПЦР-тестов на коронавирус
«Цена ошибки высока». От чего зависит результат ПЦР-тестов на коронавирус — РИА Новости, 06.12.2020
«Цена ошибки высока». От чего зависит результат ПЦР-тестов на коронавирус
Недавняя публикация ученых из Сеченовского университета о том, что почти половина анализов на возбудителя COVID-19 не дают реальной картины, вызвала множество… РИА Новости, 06.12.2020
2020-12-06T08:00
2020-12-06T08:00
2020-12-06T08:09
наука
здоровье
коронавирус covid-19
коронавирус в россии
биология
днк
геном
коронавирус sars
/html/head/meta[@name=’og:title’]/@content
/html/head/meta[@name=’og:description’]/@content
https://cdnn21.img.ria.ru/images/07e4/07/10/1574444596_0:100:3072:1828_1920x0_80_0_0_742cac6650983368c665cfe1caa14d59.jpg
МОСКВА, 6 дек — РИА Новости, Татьяна Пичугина. Недавняя публикация ученых из Сеченовского университета о том, что почти половина анализов на возбудителя COVID-19 не дают реальной картины, вызвала множество вопросов. Насколько точны ПЦР-тесты и нужны ли они для диагноза? РИА Новости разбирается в ПЦР-диагностике и почему в нее закрадываются ошибки. Как выявляют вирус в организме»Тяжело заболел наш сотрудник. Поднялась высокая температура, положили в больницу. Все признаки COVID-19, — рассказывает Алексей Чемерис, доктор биологических наук, профессор, сотрудник Института биохимии и генетики Уфимского ФИЦ РАН. — А ПЦР-анализ, который ему сделали в специальном медицинском центре наши коллеги-профессионалы, как только он почувствовал недомогание, — отрицательный. Видимо, в тот момент у больного было мало вирусных частиц в организме — за пределами чувствительности теста».Ученые называют такие результаты ложнонегативными — инфекция проявляется внешне, а тест на возбудителя — «чистый». Тут дело и в самом методе, и в его массовом применении.Когда медсестра берет мазок из ротоглотки и носоглотки, на кончике зонда остается немного влаги, а в ней — клетки эпителия. Зонд опускают в пластиковую пробирку с раствором (эппендорф) и кончик отламывают, чтобы закрыть емкость. В лаборатории ее помещают в центрифугу, проводят ряд манипуляций для выделения из клеток фрагментов вирусного генома. В случае с COVID-19 — это РНК коронавируса SARS-CoV-2.В образовавшийся раствор добавляют праймеры — искусственные участки генома коронавируса, именно они опознают SARS-CoV-2, и один из них служит затравкой для синтеза цепочки ДНК под действием определенного фермента на основе механизма обратной транскрипции. Фактически получается ДНК-копия участка коронавируса, которую уже можно размножать. Для этого запускают ПЦР — полимеразную цепную реакцию. За несколько десятков циклов она увеличивает число копий ДНК, а специальный флуоресцентный краситель подсвечивает их в пробирке, сигнализируя о вирусе. Если в биоматериале нет вирусных частиц, ампликонов (продуктов ПЦР) не будет вовсе, результат — отрицательный. Если вируса очень мало, итоговое количество ампликонов по завершении ПЦР окажется за пределами чувствительности прибора и результат — ложноотрицательным. Тонкости методаВ ПЦР-диагностике много нюансов, объясняет Алексей Чемерис. В лаборатории для научных целей выявляют даже единичные копии вирусного генома в образце, при массовом применении чувствительность обычно на порядки ниже.»Из-за случайных мутаций генома праймеры могут не сработать, если однонуклеотидные замены или даже более значительные изменения генома вируса пришлись как раз на эти участки. Вероятность невысока, но она есть», — отмечает ученый.Возможны сбои при ручных операциях, которых не так много. Одна из них — извлечение вирусной РНК из образца. Автоматический экстрактор нуклеиновых кислот стоит довольно дорого, поэтому обычно эту процедуру доверяют лаборанту. Редко, но ложноположительные результаты случаются, в том числе из-за особенностей ПЦР или загрязнения образца.Чаще всего, однако, проблемы возникают до того, как пробирка попала в лабораторию. Вот что пишут авторы статьи в журнале «Вестник Росздравнадзора»: «В настоящее время имеются неопровержимые доказательства того, что преаналитическая фаза является основным источником ошибок в лабораторных исследованиях, когда они используются для диагностических или исследовательских целей». Они публикуют целый список нарушений, ведущих к ложноотрицательным результатам. Ключевой этап — подготовка к исследованию. «За три часа до анализа нельзя есть, пить, курить и полоскать рот. Дело в том, что коронавирус поражает клетки слизистой оболочки дыхательных путей. Проникая в них, он начинает размножаться, накапливается на их поверхности. Но есть еще и эпителиальные клетки, которые часто обновляются. Вместе с водой, едой и избытком слюны при курении и жевании жвачки эпителиальные клетки попадают в пищевод. В результате вероятность обнаружить вирус в мазке падает практически до нуля», — комментирует Тамара Силкина, врач клинической лабораторной диагностики, директор по лабораторным технологиям «Гемотеста».Не менее важна процедура взятия биоматериала. Если неверно выбрать точку для мазка, например, из-за кашля или рвотного рефлекса, на зонд может не попасть достаточное количество клеток. На результат также влияют нарушения технологии хранения, транспортировки образцов.»Цена ошибки очень высока — процент выявляемости коронавирусной инфекции снизится, а скорость ее распространения вырастет. Люди, получившие ложноотрицательные результаты, будут чувствовать себя спокойно, выходить в общественные места и контактировать с окружающими», — уточняет представитель «Гемотеста».О точности диагностикиВ России одобрены к использованию десятки тест-систем для выявления коронавируса. Ключевые характеристики — диагностические специфичность (точность) и чувствительность. Первый параметр показывает способность набора определить конкретный вирус. Второй — возможность обнаружить его части, даже если в биоматериале их очень мало. «Чем эти параметры ближе к ста процентам, тем лучше», — подчеркивает Тамара Силкина.»Порог чувствительности — общий как для российских, так и для зарубежных тестов: 10³ на миллилитр. То есть должно быть не менее тысячи вирусных геном-эквивалентов на миллилитр образца. «ДНК-технология» заявила о чувствительности 10¹ — десять вирусных единиц на миллилитр. Другой важный показатель — воспроизводимость, то есть возможность получить одинаковый результат в разных условиях. Нужно учитывать и сходимость — отсутствие существенных различий между измерениями, выполненными в одинаковых условиях», — добавляет медик.Метод ПЦР с обратной транскрипцией хорошо отработан и практически полностью автоматизирован. С момента попадания в лабораторию анализ занимает четыре-шесть часов. В мире эти тесты буквально поставили на поток. Только в Москве, по официальным данным, сделали 12 миллионов анализов.Поскольку этот метод прямо выявляет возбудителя в организме, его относят к доказательной медицине и рекомендуют учитывать в клинической практике. Однако анализ больших данных говорит, что при массовом использовании ПЦР-тесты часто промахиваются.Ложнонегативные результаты получаются в 20-66 процентах случаев. Такие данные из литературы приводят исследователи из Сеченовского университета. Вместе с зарубежными коллегами они изучили записи пациентов, госпитализированных в университетскую клинику в апреле — мае. Из 3480 человек, чьи ПЦР-тесты были доступны, примерно половина оказались чистыми. В то же время клиническая картина и КТ легких указывали на коронавирусную инфекцию. Авторы допускают, что в реальной клинической практике ПЦР-анализ не столь и критичен.»Этиологическая диагностика, которая выявляет причину заболевания, нужна априори, — не соглашается Айрат Мавзютов, заведующий кафедрой фундаментальной и прикладной микробиологии, профессор кафедры лабораторной диагностики Башкирского государственного медицинского университета, руководитель Исследовательского центра «Лаборатория». — При вирусных инфекциях других, сравнимых по чувствительности и специфичности (точности), методов, кроме ПЦР-тестирования, нет».Важно понимать, объясняет профессор Мавзютов, что клинический диагноз опирается на субъективные данные — анамнез (опрос) и осмотр пациента. На их основании невозможно установить вирусную природу заболевания и тем более какой именно возбудитель его вызвал. Для этого проводятся лабораторные исследования. Получаемые при этом данные, продолжает ученый, намного объективнее, поскольку большинство современных методов лабораторных исследований автоматизировано. Соответственно, на результаты не повлияют случайные факторы: уровень подготовки специалистов, их настроение, «погода в доме» и так далее.»Диагноз COVID-19 можно поставить, только когда в материале от больного обнаружили РНК вируса SARS CoV-2 методом ПЦР или же антигены этого вируса иммунохимическими методами. Не выявив следов вируса в организме, нельзя говорить о «ковидной» природе заболевания или летального исхода», — утверждает Айрат Мавзютов.Он обращает внимание на еще один аспект. ПЦР-тест не отличает РНК вируса, способного к репродукции, то есть размножению, от обломков «нежизнеспособных» вирусных частиц. Он лишь позволяет понять, присутствует или нет РНК коронавируса в клетках. «Пока инфицированные клетки не заменятся на новые, а на это уходит от двух до четырех недель, не исключены положительные результаты. При этом вирус может быть уже «мертвым», человек здоров и никому не опасен», — отмечает профессор. Для уточнения учитываются данные целого ряда дополнительных исследований, позволяющих на лабораторном уровне оценивать остроту воспалительного процесса или образование антител на стадии его завершения.Альтернатива ПЦР-диагностикеВ любом случае нужно повышать чувствительность тест-систем на основе ПЦР, заключает Алексей Чемерис, а для этого нужны другие подходы. «Надо сделать так, чтобы ложнонегативных результатов было меньше, практически исключить их», — считает он.В обзоре, подготовленном вместе с коллегами, профессор Чемерис рассматривает преимущества и недостатки ПЦР-диагностики и других методов амплификации — копировании РНК бетакоронавирусов, к которым относится SARS-CoV-2. Теоретически весьма перспективен метод петлевой амплификации — LAMP, где используют сразу шесть или восемь праймеров.»С одной стороны, повышается специфичность: только когда все праймеры отожгутся (сработают, распознав РНК коронавируса. — Прим. ред.), начнется амплификация, с другой — вирус мутирует и шансы, что реакция не пойдет, увеличиваются, поскольку какие бы участки генома ни выбрать, все равно вероятность мутаций больше в восьми участках, чем в двух или трех (при использовании гибридизационного зонда), достаточных для ПЦР», — объясняет исследователь.Во время предшествующей эпидемии SARS возбудителя выявляли с помощью реакции NASBA (амплификации на основе секвенирования нуклеиновых кислот) и RCA (репликации по типу катящегося кольца). Геномный редактор CRISPR-Cas также пробуют применять для идентификации РНК нового коронавируса. Есть работы по полногеномному секвенированию любого генетического материала, находящегося в биоматериале. Метод очень чувствительный, но дорогой и долгий — занимает 20 часов. Так что в ближайшее время ПЦР с обратной транскрипцией останется самым массовым способом обнаружения коронавируса в организме.
https://ria.ru/20200507/1571041644.html
https://ria.ru/20201201/koronavirus-1587118633.html
https://ria.ru/20201124/kovid-1586064272.html
РИА Новости
internet-group@rian.ru
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
2020
РИА Новости
internet-group@rian.ru
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
Новости
ru-RU
https://ria.ru/docs/about/copyright.html
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/
РИА Новости
internet-group@rian.ru
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
https://cdnn21.img.ria.ru/images/07e4/07/10/1574444596_333:0:2821:1866_1920x0_80_0_0_a8001e2de8c56b736340a788be0cfca5.jpg
РИА Новости
internet-group@rian.ru
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
РИА Новости
internet-group@rian.ru
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
здоровье, коронавирус covid-19, коронавирус в россии, биология, днк, геном, коронавирус sars
Наука, Здоровье, Коронавирус COVID-19, Коронавирус в России, биология, ДНК, геном, Коронавирус SARS
МОСКВА, 6 дек — РИА Новости, Татьяна Пичугина. Недавняя публикация ученых из Сеченовского университета о том, что почти половина анализов на возбудителя COVID-19 не дают реальной картины, вызвала множество вопросов. Насколько точны ПЦР-тесты и нужны ли они для диагноза? РИА Новости разбирается в ПЦР-диагностике и почему в нее закрадываются ошибки.
Как выявляют вирус в организме
«Тяжело заболел наш сотрудник. Поднялась высокая температура, положили в больницу. Все признаки COVID-19, — рассказывает Алексей Чемерис, доктор биологических наук, профессор, сотрудник Института биохимии и генетики Уфимского ФИЦ РАН. — А ПЦР-анализ, который ему сделали в специальном медицинском центре наши коллеги-профессионалы, как только он почувствовал недомогание, — отрицательный. Видимо, в тот момент у больного было мало вирусных частиц в организме — за пределами чувствительности теста».
Ученые называют такие результаты ложнонегативными — инфекция проявляется внешне, а тест на возбудителя — «чистый». Тут дело и в самом методе, и в его массовом применении.
Когда медсестра берет мазок из ротоглотки и носоглотки, на кончике зонда остается немного влаги, а в ней — клетки эпителия. Зонд опускают в пластиковую пробирку с раствором (эппендорф) и кончик отламывают, чтобы закрыть емкость. В лаборатории ее помещают в центрифугу, проводят ряд манипуляций для выделения из клеток фрагментов вирусного генома. В случае с COVID-19 — это РНК коронавируса SARS-CoV-2.
В образовавшийся раствор добавляют праймеры — искусственные участки генома коронавируса, именно они опознают SARS-CoV-2, и один из них служит затравкой для синтеза цепочки ДНК под действием определенного фермента на основе механизма обратной транскрипции. Фактически получается ДНК-копия участка коронавируса, которую уже можно размножать. Для этого запускают ПЦР — полимеразную цепную реакцию. За несколько десятков циклов она увеличивает число копий ДНК, а специальный флуоресцентный краситель подсвечивает их в пробирке, сигнализируя о вирусе. Если в биоматериале нет вирусных частиц, ампликонов (продуктов ПЦР) не будет вовсе, результат — отрицательный. Если вируса очень мало, итоговое количество ампликонов по завершении ПЦР окажется за пределами чувствительности прибора и результат — ложноотрицательным.
Тонкости метода
В ПЦР-диагностике много нюансов, объясняет Алексей Чемерис. В лаборатории для научных целей выявляют даже единичные копии вирусного генома в образце, при массовом применении чувствительность обычно на порядки ниже.
«Из-за случайных мутаций генома праймеры могут не сработать, если однонуклеотидные замены или даже более значительные изменения генома вируса пришлись как раз на эти участки. Вероятность невысока, но она есть», — отмечает ученый.
Возможны сбои при ручных операциях, которых не так много. Одна из них — извлечение вирусной РНК из образца. Автоматический экстрактор нуклеиновых кислот стоит довольно дорого, поэтому обычно эту процедуру доверяют лаборанту. Редко, но ложноположительные результаты случаются, в том числе из-за особенностей ПЦР или загрязнения образца.
Чаще всего, однако, проблемы возникают до того, как пробирка попала в лабораторию. Вот что
пишут
авторы статьи в журнале «Вестник Росздравнадзора»: «В настоящее время имеются неопровержимые доказательства того, что преаналитическая фаза является основным источником ошибок в лабораторных исследованиях, когда они используются для диагностических или исследовательских целей». Они публикуют целый список нарушений, ведущих к ложноотрицательным результатам.
Ключевой этап — подготовка к исследованию. «За три часа до анализа нельзя есть, пить, курить и полоскать рот. Дело в том, что коронавирус поражает клетки слизистой оболочки дыхательных путей. Проникая в них, он начинает размножаться, накапливается на их поверхности. Но есть еще и эпителиальные клетки, которые часто обновляются. Вместе с водой, едой и избытком слюны при курении и жевании жвачки эпителиальные клетки попадают в пищевод. В результате вероятность обнаружить вирус в мазке падает практически до нуля», — комментирует Тамара Силкина, врач клинической лабораторной диагностики, директор по лабораторным технологиям «Гемотеста».
Не менее важна процедура взятия биоматериала. Если неверно выбрать точку для мазка, например, из-за кашля или рвотного рефлекса, на зонд может не попасть достаточное количество клеток. На результат также влияют нарушения технологии хранения, транспортировки образцов.
«Цена ошибки очень высока — процент выявляемости коронавирусной инфекции снизится, а скорость ее распространения вырастет. Люди, получившие ложноотрицательные результаты, будут чувствовать себя спокойно, выходить в общественные места и контактировать с окружающими», — уточняет представитель «Гемотеста».
О точности диагностики
В России одобрены к использованию десятки тест-систем для выявления коронавируса. Ключевые характеристики — диагностические специфичность (точность) и чувствительность. Первый параметр показывает способность набора определить конкретный вирус. Второй — возможность обнаружить его части, даже если в биоматериале их очень мало. «Чем эти параметры ближе к ста процентам, тем лучше», — подчеркивает Тамара Силкина.
«Порог чувствительности — общий как для российских, так и для зарубежных тестов: 10³ на миллилитр. То есть должно быть не менее тысячи вирусных геном-эквивалентов на миллилитр образца. «ДНК-технология» заявила о чувствительности 10¹ — десять вирусных единиц на миллилитр. Другой важный показатель — воспроизводимость, то есть возможность получить одинаковый результат в разных условиях. Нужно учитывать и сходимость — отсутствие существенных различий между измерениями, выполненными в одинаковых условиях», — добавляет медик.
Метод ПЦР с обратной транскрипцией хорошо отработан и практически полностью автоматизирован. С момента попадания в лабораторию анализ занимает четыре-шесть часов. В мире эти тесты буквально поставили на поток. Только в Москве, по официальным данным, сделали 12 миллионов анализов.
1 из 6
Медицинский работник берет мазок у пациентки в поликлинике № 28 в Волгограде
2 из 6
Для взятия мазков существуют универсальные наборы с длинным зондом. После взятия мазка зонд помещают в пробирку-эппендорф и герметично закрывают. ООО «Лаборатория Гемотест» в Тамбове
3 из 6
Медицинская сестра наклеивает индивидуальный штрихкод на пробирку с ПЦР-тестом на коронавирус COVID-19
4 из 6
Бокс приготовления реакционных смесей и проведения ПЦР (полимеразной цепной реакции). Микробиологическая лаборатория ФБУЗ » Центр гигиены и эпидемиологии в Краснодарском крае»
5 из 6
Станция для проведения ПЦР-тестов
6 из 6
Вход в ПЦР-бокс лаборатории ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Архангельской области»
1 из 6
Медицинский работник берет мазок у пациентки в поликлинике № 28 в Волгограде
2 из 6
Для взятия мазков существуют универсальные наборы с длинным зондом. После взятия мазка зонд помещают в пробирку-эппендорф и герметично закрывают. ООО «Лаборатория Гемотест» в Тамбове
3 из 6
Медицинская сестра наклеивает индивидуальный штрихкод на пробирку с ПЦР-тестом на коронавирус COVID-19
4 из 6
Бокс приготовления реакционных смесей и проведения ПЦР (полимеразной цепной реакции). Микробиологическая лаборатория ФБУЗ » Центр гигиены и эпидемиологии в Краснодарском крае»
5 из 6
Станция для проведения ПЦР-тестов
6 из 6
Вход в ПЦР-бокс лаборатории ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Архангельской области»
Поскольку этот метод прямо выявляет возбудителя в организме, его относят к доказательной медицине и рекомендуют учитывать в клинической практике. Однако анализ больших данных говорит, что при массовом использовании ПЦР-тесты часто промахиваются.
Ложнонегативные результаты получаются в 20-66 процентах случаев. Такие данные из литературы приводят исследователи из Сеченовского университета. Вместе с зарубежными коллегами они
изучили
записи пациентов, госпитализированных в университетскую клинику в апреле — мае. Из 3480 человек, чьи ПЦР-тесты были доступны, примерно половина оказались чистыми. В то же время клиническая картина и КТ легких указывали на коронавирусную инфекцию. Авторы допускают, что в реальной клинической практике ПЦР-анализ не столь и критичен.
«Этиологическая диагностика, которая выявляет причину заболевания, нужна априори, — не соглашается Айрат Мавзютов, заведующий кафедрой фундаментальной и прикладной микробиологии, профессор кафедры лабораторной диагностики Башкирского государственного медицинского университета, руководитель Исследовательского центра «Лаборатория». — При вирусных инфекциях других, сравнимых по чувствительности и специфичности (точности), методов, кроме ПЦР-тестирования, нет».
Важно понимать, объясняет профессор Мавзютов, что клинический диагноз опирается на субъективные данные — анамнез (опрос) и осмотр пациента. На их основании невозможно установить вирусную природу заболевания и тем более какой именно возбудитель его вызвал. Для этого проводятся лабораторные исследования. Получаемые при этом данные, продолжает ученый, намного объективнее, поскольку большинство современных методов лабораторных исследований автоматизировано. Соответственно, на результаты не повлияют случайные факторы: уровень подготовки специалистов, их настроение, «погода в доме» и так далее.
«Диагноз COVID-19 можно поставить, только когда в материале от больного обнаружили РНК вируса SARS CoV-2 методом ПЦР или же антигены этого вируса иммунохимическими методами. Не выявив следов вируса в организме, нельзя говорить о «ковидной» природе заболевания или летального исхода», — утверждает Айрат Мавзютов.
Он обращает внимание на еще один аспект. ПЦР-тест не отличает РНК вируса, способного к репродукции, то есть размножению, от обломков «нежизнеспособных» вирусных частиц. Он лишь позволяет понять, присутствует или нет РНК коронавируса в клетках.
«Пока инфицированные клетки не заменятся на новые, а на это уходит от двух до четырех недель, не исключены положительные результаты. При этом вирус может быть уже «мертвым», человек здоров и никому не опасен», — отмечает профессор. Для уточнения учитываются данные целого ряда дополнительных исследований, позволяющих на лабораторном уровне оценивать остроту воспалительного процесса или образование антител на стадии его завершения.
Альтернатива ПЦР-диагностике
В любом случае нужно повышать чувствительность тест-систем на основе ПЦР, заключает Алексей Чемерис, а для этого нужны другие подходы. «Надо сделать так, чтобы ложнонегативных результатов было меньше, практически исключить их», — считает он.
В
обзоре
, подготовленном вместе с коллегами, профессор Чемерис рассматривает преимущества и недостатки ПЦР-диагностики и других методов амплификации — копировании РНК бетакоронавирусов, к которым относится SARS-CoV-2. Теоретически весьма перспективен метод петлевой амплификации — LAMP, где используют сразу шесть или восемь праймеров.
«С одной стороны, повышается специфичность: только когда все праймеры отожгутся (сработают, распознав РНК коронавируса. — Прим. ред.), начнется амплификация, с другой — вирус мутирует и шансы, что реакция не пойдет, увеличиваются, поскольку какие бы участки генома ни выбрать, все равно вероятность мутаций больше в восьми участках, чем в двух или трех (при использовании гибридизационного зонда), достаточных для ПЦР», — объясняет исследователь.
Во время предшествующей эпидемии SARS возбудителя выявляли с помощью реакции NASBA (амплификации на основе секвенирования нуклеиновых кислот) и RCA (репликации по типу катящегося кольца). Геномный редактор CRISPR-Cas также пробуют применять для идентификации РНК нового коронавируса. Есть работы по полногеномному секвенированию любого генетического материала, находящегося в биоматериале. Метод очень чувствительный, но дорогой и долгий — занимает 20 часов. Так что в ближайшее время ПЦР с обратной транскрипцией останется самым массовым способом обнаружения коронавируса в организме.
Тест на COVID-19 нужен, если есть симптомы заболевания, вы контактировали с зараженным, собираетесь в путешествие или только что вернулись из него. Разбираемся, какие бывают тесты на COVID-19 и когда появляются антитела к коронавирусу после болезни.
В чем разница между ПЦР и ИФА-тестом на COVID-19
ПЦР (полимеразная цепная реакция) — тест, который показывает наличие генетического материала возбудителей инфекционных заболеваний.
Он определяет, есть ли вирус в организме на момент забора биологического материала (например, крови, слизи из полости носа и т. д.), а также его фрагментов после выздоровления. ПЦР-тест считается «золотым стандартом» в диагностике COVID-19.
ИФА (иммуноферментный и иммунохемилюминесцентный анализ) — анализ крови, который определяет иммуноглобулины (антитела) IgM и IgG к SARS-CoV-2. Они появляются, когда человек переболел или вакцинировался.
ИФА-тест на IgM лучше сдать на 5–7 день после появления симптомов инфекции, он может стать альтернативой ПЦР в период активной стадии болезни. А с помощью теста на IgG можно понять, выработался ли у пациента иммунитет к COVID-19 — это лучше проверять через несколько недель после первых симптомов.
Как проводятся тесты на коронавирус
Для ПЦР-теста на COVID-19 у вас возьмут мазок из носа или ротоглотки и отправят в лабораторию на исследование. Результаты будут готовы максимум через два дня.
Тест на антиген проводится по той же технологии, что и ПЦР. Сделать тест на IgM можно самостоятельно. Для этого существуют специальные экспресс-тесты, которые показывают результат уже через 15-30 минут. Однако этот метод диагностики может быть менее надежным для людей без симптомов — значит, есть риск получить ложноотрицательный результат.
Выявить антиген IgG можно с помощью лабораторного иммуноферментного анализа крови.
Как узнать результаты тестов на коронавирус
С ПЦР и тестом на антиген IgM все просто — они показывают положительный/отрицательный тест на коронавирус. Положительный тест на IgG показывает, что пациент привился или переболел коронавирусом минимум три недели назад.
Если по результатам анализов IgG в крови не обнаружено, это может означать, что человек:
- болеет прямо сейчас, и организм не успел выработать антитела
- не болел и не вакцинировался
- переболел COVID-19 и/или привился, но антител слишком мало
Как долго сохраняются антитела к коронавирусу после болезни или вакцины
После перенесенного заболевания уровень IgG высокий в течение месяца или чуть больше, а затем постепенно снижается. А после вакцинации он остается в организме чуть дольше.
По данным исследований, через три недели после второй дозы «Спутник V» антитела выявляются у 80% людей, но через полгода после вакцины уровень IgG снижается почти в девять раз.
Как именно вырабатывается и сохраняется иммунитет к коронавирусу — пока точно неясно. Также нет однозначной информации, какой уровень антител может на 100% защитить вас от заражения.
ПЦР-тест на коронавирус: что показывает и как делают
Сегодня наиболее достоверным способом выявления коронавирусной инфекции считается ПЦР-тест. Точность его составляет не менее 99%, даже если течение болезни не имеет симптомов. Суть метода заключается в молекулярно-генетической диагностике путем изучения полимеразно-цепной реакции, при которой возможно определение вируса в организме. Это помогает узнавать о присутствии вирусной РНК на ранней стадии еще до того, как появятся признаки ковид или сформируются антитела.
Содержание статьи
- Виды лабораторной диагностики
- Подготовка к тесту на коронавирус методом ПЦР
- Особенности проведения и результаты ПЦР-диагностики
- Что еще способно повлиять на результаты тестирования ковида?
Виды лабораторной диагностики
Общее диагностирование в период массового распространения Covid желательно делать с целью оценки иммунитета и способности организма противостоять чужеродным клеткам и патогенам. Для чего необходимо проводить:
- общий клинический анализ крови. Обычно сдавать нужно из пальца;
- биохимический анализ крови. Результат позволит выявить развитие осложнений в виде функциональных нарушений органов и систем, декомпенсацию сопутствующих заболеваний;
- исследование уровня СРБ в сыворотке крови, благодаря которому получают информацию о тяжести течения ковид и распространенности воспалительного процесса, чтобы сделать дальнейший прогноз при возникновении пневмонии;
- сдавать ИФА сыворотки (иммуноферментный анализ) для обнаружения антител lgG/lgA, свидетельствующих о недавно перенесенном или текущем заболевании, чтобы выяснить стадию его развития. Брать кровь будут из локтевой вены.
В случае если во время пульсоксиметрии, назначенной для проверки содержания количества кислорода в крови (SpO2), прибор будет показывать сатурацию ниже 95%, то это означает, что пациент нуждается в респираторной поддержке. При имеющихся признаках острой дыхательной недостаточности будут брать материал на коагулограмму для определения времени свертываемости крови, характеризующего скорость и риск активного тромбообразования. Кровь придется сдавать тоже из вены.
Специфическое обследование на SARS-CoV-2 делают двумя способами: методом ПЦР и посредством экспресс-тестирования.
Подготовка к тесту на коронавирус методом ПЦР
От того, насколько правильно человек накануне будет подготовлен к тестированию, зависит достоверность его результата. Что для этого необходимо делать:
- воздержаться от употребления алкоголя не менее чем за двое суток до забора материала;
- минимум за 3-4 часа постараться не полоскать дезрастворами рот, откуда придется брать образец;
- перед тем, как сдавать мазок, не чистить зубы, не рассасывать таблетки с антисептическими свойствами;
- в день сдачи не капать в нос капли, не применять мази;
- до того, как будет браться биоматериал, не использовать какие-либо освежающие полость рта спреи и декоративную косметику для губ;
- часа за три отказаться от курения, приема пищи и воды;
- заранее освободить носовую полость от избыточной слизи (если она присутствует).
Делать данное тестирование лучше тем людям, кто не вступал в контакт с больными ковид на протяжении 14 дней и у кого отсутствуют признаки респираторной инфекции в виде слабости, кашля, одышки, гипертермии и пр. При себе следует иметь паспорт, СНИЛС, ИНН.
Обращаем ваше внимание, что специалисты клиник берут мазки с использованием обязательных средств индивидуальной защиты.
Сеть медицинских центров «CityMed» проводит любые виды тестирования в организациях, расположенных в г. Москве, или на дому у клиента. Если вы планируете сдавать анализы, то для получения более подробной информации или заключения договора можете связаться с оператором по указанному на сайте номеру колл-центра.
Особенности проведения и результаты ПЦР-диагностики
Как делают ПЦР-тест на ковид? Суть процедуры заключается в том, что для максимально точного результата мазок должен браться правильно: с поверхности небных дужек, миндалин, носовых ходов. Причем в последнем случае зонд вводится вращательными движениями достаточно глубоко с прижатием к стенкам слизистой. Если брать мазок из преддверия отверстий, то он может не показывать реальную картину, а демонстрировать только отрицательный результат.
Перед тем, как сдавать, предупредите медперсонал заранее об искривлении перегородки или проведенных оперативных вмешательствах на полости носа.
Что еще способно повлиять на результаты тестирования ковида?
Нарушение техники взятия мазка при случайном касании перчатки или других посторонних предметов приводит к загрязнению тампона. Контаминация может произойти за счет заражения реагентов, рабочих зон, лабораторного оборудования посторонними РНК и ДНК, что зачастую становится причиной ложноположительного результата ПЦР-теста.
Помимо вышеперечисленных технических проблем на искажение информативности влияют неправильные подготовка или самостоятельное взятие мазка пациентом.
Хотя это довольно несложная и безопасная процедура, но если делать ее некорректно, то тестирование будет ошибочным. Когда в доме проживает несколько членов семьи, брать нужно для каждого отдельный набор, включающий:
- Анкету пациента.
- Инструкцию, как и откуда следует брать мазок для выполнения теста на ковид.
- Транспортировочную упаковку.
- 3 одинаковых стерильных зонда для забора материала (два для каждого носового хода и один для ротоглотки).
- Шпатель для более удобного доступа к ротоглотке.
- Пробирку со средой (эппендорф).
- Зип-пакетик для пробирки.
- Термопакет для упаковки готового биоматериала.
По окончании манипуляции термопакеты отдаются на руки курьеру или их приносят в медицинскую организацию сами пациенты. Узнать результаты проверки теста можете любым удобным для вас способом: по телефону или электронной почте.
Обращаем ваше внимание, что СитиМед соблюдает все правила по забору, транспортировке и хранению биоматериала в соответствии с методическим рекомендациям МЗ Российской Федерации.